本中心主要任務如下：

(一) 環境污染整治技術研發。

(二) 潔淨能源、低碳能源及綠色環境技術研發。

(三) 環境資材資源循環技術研發。

(四) 接受委辦及執行環境及能源研究之專案計畫。

(五) 提供環境及能源相關專業技術及檢測服務。

(六) 辦理環境及能源相關議題之推廣、教育、訓練及研討會等活動。

(七) 促進國際間環境及能源科技之技術交流。

(八) 其他與環境與能源科技有關之事宜。